Los técnicos de Agrocalidad día a día reciben agresiones verbales y físicas por la labor que realizan en los puestos de control fronterizo. Los contrabandistas incluso amenazan de muerte a los funcionarios.
El lunes 30 de enero de este año, técnicos de la entidad fitosanitaria fueron agredidos mientras realizaban el control a un vehículo procedente de Perú. Al sentirse incómodos por la revisión, los ocupantes del camión de carga procedieron a agredir a los técnicos tirándoles piedras y palos.