El buque de investigación Orión ha realizado cerca de una centena de cruceros hidrográficos y  oceanográficos.  Entre las misiones más importantes se anotan las siguientes:

Tres expediciones hacia la Antártida (1988, 1990 y 1998), cuyos resultados fueron fundamentales para la adhesión del  Ecuador al  Tratado Antártico.

Además de los cruceros anuales conjuntos entre Colombia, Perú, Chile y Ecuador, cuyo objetivo principal es el estudio de las condiciones meteorológicas y oceanográficas en el Pacífico Oriental, para medir la probabilidad de ocurrencia   del fenómeno El Niño