Los habitantes de los sectores afectados por la contaminación señalan que los desechos llegan arrastrados por la marea y las lluvias. En algunos sitios el color del agua evidencia la degradación del estuario, según especialistas.

Honduras y Guatemala se enfrentan por las toneladas de plásticos y desechos hospitalarios que cubren sus orillas. Los residuos afectan el Sistema Arrecifal Mesoamericano.