El conflicto empezó luego de que el ejército del Perú invadió territorio nacional; la ofensiva del ejército ecuatoriano inició el día 26 de enero de 1995 a las 17:56 con fuego de morteros. Los enfrentamientos se extendieron hasta mayo.

En la guerra entre Ecuador y Perú de 1995, el teniente coronel Fausto Flores perdió las piernas, pero con el apoyo familiar, de los compañeros y el deporte, pudo sobreponerse. Es uno de los asiduos corredores de la prueba quiteña.

Esperó casi dos décadas para ser lo que, finalmente, es ahora: un general de brigada. Es héroe de la patria por su participación en la guerra del Cenepa. Además impulsó a que las mujeres accedan a la carrera militar.